Inicialmente, em função dos limites territoriais entre Porto Alegre e Viamão não estarem bem definidos, a região da Lomba do Pinheiro pertencia ao município de Viamão. Foi o então prefeito de Viamão, FREDERICO DHIL, quem criou, através do decreto nº 338 de 27 de novembro de 1962, uma sala de aula na Vila Panorama, na rua Sepé Tiaraju. O nome SAINT'HILAIRE foi uma homenagem ao biólogo pesquisador Augustin François César Prouvençal de Saint-Hilaire, cujo nome já havia sido atribuído a um parque nas imediações da escola.
Unidade de Conservação - Parque Saint Hilaire
Nessa ocasião, recebeu um prédio novo com cinco salas de aula, no qual atendia alunos de 1ª à 4ª série, e contava com cozinha, secretaria e sala para a Direção, sob a administração do prefeito de Viamão, TAPIR ROCHA.
Em 1990, os moradores mobilizados conseguiram anexar a localidade da Lomba do Pinheiro ao Município de Porto Alegre, que até então, administrava a região da Lomba anterior à parada 12.
A Lei Estadual nº 9641, de 26 de março de 1992 retificou os limites entre os dois municípios. Assim, toda Lomba do Pinheiro passou a pertencer a Porto Alegre. A escola passa a integrar a Rede de Educação desse Município.
A mobilização dos moradores do bairro conseguiu melhorias no sistema de água, luz, saneamento básico, pavimentação, transporte e construção de novas escolas, visto que as existentes não mais atendiam à demanda de alunos da região.
Foi através do envolvimento da comunidade com o ORÇAMENTO PARTICIPATIVO que se concretizou a necessidade de ampliação da escola. Em outubro de 1993, foi realizada a primeira eleição para compor o Conselho Escolar, conforme a Lei complementar nº 292, do artigo 18. No mês de abril de 1995 começaram as obras de construção.
Em setembro de 1996, é inaugurado um segundo prédio instrumentalizando a escola a atender cerca de 600 alunos em três turnos.
O SEJA começa a funcionar em 18 de junho desse mesmo ano. A escola passou a contar com 11 funcionários para a cozinha e limpeza e 42 professores. A obra incluía setores administrativos biblioteca, sala para Laboratório, dez salas de aula (13 turmas de 1ª à 4ª série, 5 turmas de 5ª e 6ª série e 3 turmas do SEJA (Serviço de Educação de Jovens e Adultos), cozinha, refeitório, despensa, banheiros, sala para os funcionários e professores, telefone, pátio gramado e cercado.
Augustin François César Prouvençal de Saint-Hilaire
Naturalista francês, origem do nome da escola.
A escola foi ciclada por determinação da mantenedora, em fins de 1997, iniciando o ano letivo de 1998, com o 1º Ciclo, ao invés das séries iniciais e da pré-escola.
Em dezembro de 1997, foi entregue à comunidade escolar o terceiro prédio da escola, capacitando-a atender em torno de 1100 alunos. Juntamente com esse processo, foi autorizado o funcionamento da 7ª série pelo parecer nº 022/97, de 17 de dezembro. Em 26 de junho de 1998, a Biblioteca passou a chamar-se Sérgio Caparelli.
Em 5 de março de 1998, através do parecer nº 98, o Conselho Estadual de Educação autoriza o funcionamento da 8ª série, a escola passa a ser uma Escola Municipal de Ensino Fundamental.
Em 1999, a escola passa a usufruir um ambiente informatizado (Laboratório de Informática) como proposta de diversificação pedagógica da escola por Ciclos.
Em março de 1999, o ano letivo já iniciou com todo o Ensino Fundamental organizado por Ciclos de Formação.
Em 2003 são construídas salas emergenciais para atender a demanda de alunos para o 2º ano do primeiro ciclo. Em 2004, essas salas passaram a funcionar como espaço de Arte-Educação.
Também através da participação no Orçamento participativo Escolar, inauguramos uma moderna sala de multimeios, contando com televisor 29“, retroprojetor, episcópio, DVD, telão, projetor de slides, cadeiras estofadas para mais de sessenta espectadores, persianas e murais.
Em 2006, a escola inicia participação no projeto federal Escola Aberta, ampliando as relações com a comunidade escolar ao oferecer oficinas e atividades recreativas aos alunos e comunidade em geral.
No ano de 2012, a escola completa 50 anos.
